Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SGCBQ16585 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCBQ16585 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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