Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USF2Q15853 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USF2Q15853 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USF2Q15853 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USF2Q15853 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USF2Q15853 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USF2Q15853 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USF2Q15853 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USF2Q15853 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USF2Q15853 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USF2Q15853 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USF2Q15853 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USF2Q15853 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USF2Q15853 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USF2Q15853 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USF2Q15853 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USF2Q15853 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USF2Q15853 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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