Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A5Q15758 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A5Q15758 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms