Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX1Q15475 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX1Q15475 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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