Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS6KA1Q15418 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS6KA1Q15418 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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