Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTF1Q15361 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTF1Q15361 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTF1Q15361 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF1Q15361 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTF1Q15361 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TTF1Q15361 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTF1Q15361 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTF1Q15361 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTF1Q15361 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTF1Q15361 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTF1Q15361 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTF1Q15361 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF1Q15361 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF1Q15361 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF1Q15361 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TTF1Q15361 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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