Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RABEP1Q15276 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms