Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDK3Q15120 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK3Q15120 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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