Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB3GAP1Q15042 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3GAP1Q15042 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
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