Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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