Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCINQ13939 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCINQ13939 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCINQ13939 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCINQ13939 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCINQ13939 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCINQ13939 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCINQ13939 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCINQ13939 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCINQ13939 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCINQ13939 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCINQ13939 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCINQ13939 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCINQ13939 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCINQ13939 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCINQ13939 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCINQ13939 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCINQ13939 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCINQ13939 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCINQ13939 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCINQ13939 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCINQ13939 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCINQ13939 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCINQ13939 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCINQ13939 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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