Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOFQ13790 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOFQ13790 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOFQ13790 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOFQ13790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOFQ13790 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOFQ13790 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOFQ13790 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOFQ13790 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOFQ13790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOFQ13790 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOFQ13790 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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APOFQ13790 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOFQ13790 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOFQ13790 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOFQ13790 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOFQ13790 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOFQ13790 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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