Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSAMPQ13449 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms