Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSLNQ13421 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSLNQ13421 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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