Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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