Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4Q12950 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4Q12950 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4Q12950 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4Q12950 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4Q12950 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4Q12950 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4Q12950 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4Q12950 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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FOXD4Q12950 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4Q12950 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4Q12950 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4Q12950 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4Q12950 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4Q12950 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4Q12950 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4Q12950 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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