Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHD3Q12873 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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