Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STX4Q12846 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STX4Q12846 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STX4Q12846 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STX4Q12846 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STX4Q12846 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX4Q12846 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX4Q12846 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX4Q12846 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX4Q12846 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX4Q12846 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX4Q12846 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX4Q12846 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX4Q12846 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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