Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TROQ12816 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TROQ12816 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TROQ12816 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TROQ12816 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TROQ12816 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TROQ12816 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TROQ12816 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TROQ12816 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TROQ12816 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TROQ12816 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TROQ12816 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TROQ12816 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TROQ12816 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TROQ12816 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TROQ12816 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TROQ12816 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TROQ12816 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TROQ12816 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TROQ12816 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TROQ12816 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TROQ12816 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TROQ12816 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TROQ12816 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TROQ12816 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TROQ12816 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TROQ12816 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TROQ12816 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TROQ12816 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TROQ12816 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TROQ12816 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TROQ12816 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TROQ12816 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TROQ12816 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TROQ12816 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TROQ12816 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
TROQ12816 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TROQ12816 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TROQ12816 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TROQ12816 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TROQ12816 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TROQ12816 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TROQ12816 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TROQ12816 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TROQ12816 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TROQ12816 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TROQ12816 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
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