Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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GTF3C1Q12789 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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GTF3C1Q12789 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GTF3C1Q12789 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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GTF3C1Q12789 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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GTF3C1Q12789 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3C1Q12789 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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GTF3C1Q12789 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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