Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAPQ12770 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPQ12770 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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