Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAGPQ0VAQ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms