Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCBP1Q09161 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCBP1Q09161 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCBP1Q09161 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms