Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms