Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL18Q07020 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms