Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX1T1Q06455 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX1T1Q06455 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms