Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REG3AQ06141 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REG3AQ06141 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms