Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRYQ05066 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRYQ05066 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRYQ05066 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRYQ05066 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRYQ05066 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRYQ05066 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRYQ05066 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRYQ05066 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRYQ05066 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRYQ05066 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRYQ05066 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRYQ05066 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRYQ05066 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRYQ05066 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRYQ05066 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms