Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD164Q04900 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD164Q04900 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CD164Q04900 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CD164Q04900 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms