Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBE1Q04446 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms