Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms