Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OC90Q02509 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OC90Q02509 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OC90Q02509 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OC90Q02509 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OC90Q02509 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OC90Q02509 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OC90Q02509 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OC90Q02509 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OC90Q02509 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OC90Q02509 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OC90Q02509 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OC90Q02509 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OC90Q02509 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OC90Q02509 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OC90Q02509 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OC90Q02509 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OC90Q02509 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OC90Q02509 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OC90Q02509 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OC90Q02509 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OC90Q02509 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OC90Q02509 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
OC90Q02509 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OC90Q02509 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OC90Q02509 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OC90Q02509 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms