Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDR2Q01850 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms