Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK3Q00526 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK3Q00526 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms