Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKD1P98161 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKD1P98161 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKD1P98161 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKD1P98161 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKD1P98161 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PKD1P98161 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKD1P98161 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PKD1P98161 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PKD1P98161 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKD1P98161 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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