Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPXP78539 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRPXP78539 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRPXP78539 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRPXP78539 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRPXP78539 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRPXP78539 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRPXP78539 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRPXP78539 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRPXP78539 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms