Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC5P78333 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC5P78333 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC5P78333 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC5P78333 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC5P78333 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GPC5P78333 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC5P78333 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC5P78333 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC5P78333 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC5P78333 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC5P78333 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC5P78333 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC5P78333 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC5P78333 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC5P78333 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC5P78333 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC5P78333 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC5P78333 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC5P78333 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC5P78333 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC5P78333 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC5P78333 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC5P78333 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC5P78333 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC5P78333 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC5P78333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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