Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSNL1P62760 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms