Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD1P62314 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms