Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP4P57723 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms