Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA1P56199 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms