Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX9P55771 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX9P55771 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAX9P55771 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX9P55771 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX9P55771 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX9P55771 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX9P55771 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX9P55771 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX9P55771 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX9P55771 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX9P55771 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX9P55771 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX9P55771 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX9P55771 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX9P55771 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX9P55771 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms