Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HADHBP55084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHBP55084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHBP55084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHBP55084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HADHBP55084 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHBP55084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHBP55084 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHBP55084 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHBP55084 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHBP55084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HADHBP55084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HADHBP55084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HADHBP55084 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HADHBP55084 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHBP55084 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHBP55084 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHBP55084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHBP55084 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHBP55084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHBP55084 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHBP55084 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHBP55084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHBP55084 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHBP55084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHBP55084 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHBP55084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms