Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAG1P54619 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAG1P54619 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAG1P54619 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAG1P54619 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAG1P54619 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAG1P54619 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms