Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTBP53611 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTBP53611 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
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