Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E1P51965 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2E1P51965 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms