Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms