Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3AP50213 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms