Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF6P49848 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF6P49848 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF6P49848 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF6P49848 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF6P49848 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF6P49848 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF6P49848 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF6P49848 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF6P49848 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF6P49848 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF6P49848 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF6P49848 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF6P49848 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF6P49848 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF6P49848 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF6P49848 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF6P49848 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF6P49848 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF6P49848 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF6P49848 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF6P49848 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF6P49848 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF6P49848 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF6P49848 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF6P49848 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF6P49848 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF6P49848 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF6P49848 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF6P49848 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF6P49848 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF6P49848 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF6P49848 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF6P49848 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF6P49848 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF6P49848 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF6P49848 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF6P49848 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF6P49848 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF6P49848 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF6P49848 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF6P49848 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF6P49848 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF6P49848 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF6P49848 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms