Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGS4P49798 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGS4P49798 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGS4P49798 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGS4P49798 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGS4P49798 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGS4P49798 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGS4P49798 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGS4P49798 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGS4P49798 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGS4P49798 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGS4P49798 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGS4P49798 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGS4P49798 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGS4P49798 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGS4P49798 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGS4P49798 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGS4P49798 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGS4P49798 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGS4P49798 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGS4P49798 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms